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Pour tous les mammifères, la flore digestive est un point important de la digestion, aussi bien une source de bonne santé que de pathologies.

Chez le cheval, le lien entre l’animal et sa flore est particulièrement fort puisque seule la flore peut digérer la cellulose des fourrages, élément majoritaire de l’apport énergétique de la ration. Les produits de la fermentation, que sont les acides gras volatils, sont récupérés par le cheval et métabolisés pour obtenir l’énergie. Ce rôle est primordial dans la digestion de la ration.

Cette flore est un équilibre fragile de différentes espèces en fonction des types de nutriments disponibles (sucres solubles, amidon, cellulose) et des déchets métabolisables produits par les fermentations.

Les perturbations de cet équilibre peuvent provenir de l’alimentation, de pathologies, de troubles digestifs, de médicaments et de toxines. Ces perturbations de la flore entraînent des pathologies allant de coliques sans gravité à des pathologies lourdes (fourbure, encéphalopathie…) voire à la mort.

La gestion de cette flore digestive est une préoccupation de l’éleveur, de l’agronome et du vétérinaire. Elle passe par une transition alimentaire dans les cas de changement d’alimentation et dans le cas de perturbation, l’utilisation raisonnée de prébiotiques et de probiotiques.

Sur le terrain, la difficulté est de prévoir la réaction de la flore digestive dans les cas les plus délicats. La seule règle à avoir est de faire preuve de prudence.

Le milieu marin héberge la plus grande partie de la biodiversité de notre planète, associée à une incroyable chimiodiversité. En effet, les organismes marins, vivant dans un milieu hautement compétitif, produisent des métabolites bioactifs extrêmement puissants à des fins de protection, communication, ou encore compétition pour l’espace. Les éponges marines, animaux sessiles les plus primitifs, sont le centre d’intérêt de nombreuses équipes de recherche et parmi les invertébrés marins les plus producteurs de métabolites bioactifs. Animaux suspensivores, les éponges se nourrissent par filtration de l’eau environnante, et sont ainsi les hôtes d’une importante diversité de micro-organismes. Il est de plus en plus proposé, que ces micro-organismes associés seraient la véritable source de ces métabolites bioactifs. De ce fait, l’exploitation des éponges marines et de leurs micro-organimes associés est aujourd’hui plus que prometteuse et pourrait bien être l’avenir de demain en matière de santé et recherche médicale.