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  • Prédiction de l'expression de PD-L1 sur scanner pré-thérapeutique dans une cohorte rétrospective de patients atteints d'adénocarcinome gastrique avancé    - Zemmour Yacine  -  09 octobre 2023  - Thèse d'exercice

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    Introduction : Les indications actuelles d'immunothérapie dans la prise en charge des cancers gastriques avancés sont soumises à un biomarqueur. Il s'agit de l'expression du Programmes Death Ligand 1 (PD-L1), évaluée en immunochimie en calculant le Combined Positive Score (CPS). L'évaluation de ce marqueur est chronophage, opérateur-dépendant et hétérogène au sein de la même tumeur.

    Objectif : cette étude vise à prédire l'expression de PD-L1 chez des patients atteints d'adénocarcinome gastrique avancé, sur scanner pré-thérapeutique par un algorithme de Deep Learning, cherchant ainsi à identifier un biomarqueur plus simple, reproductif et non invasif.

    Méthode : Nous avons mené une étude rétrospective multicentrique, issue du CHU de Poitiers, et de la cohorte NORDICAP du CHU Saint-Louis (Paris), cette étude a inclus tous les patients atteints d'un adénocarcinome gastrique avancé et ayant été suivis entre janvier 2012 à décembre 2020. Le CPS a été calculé pour chaque patient avec relecture par un senior. Les images de tomodensitométrie ont été collectées et segmentées à l'aide de l'outil Total Segmentator. Afin de prédire le CPS sur les images de tomodensitométrie, différentes architectures : Squeeze qnd Excitation Ntework (SENet), DenseNet et EfficientB7 ont été utilisées et comparées entre elles. Une validation croisée à cinq plis a été utilisée pour évaluer la performance des différents modèles. Les indices d'évaluation adoptés dans cet article comprennent la matrice de confusion, l'aire sous la courbe (AUC), la validation, la précision, le rappel.

    Résultats : Au total sur les 58 patients atteints de cancer de l'estomac inclus et analysés dans notre étude (23 CPS positifs, 35 CPS négatifs, en immunohistochimie), le modèle SENet (192,192,96) a correctement prédit le score CPS pour 41 patiens (13 CPS positifs, 28 CPS négatifs). Ce modèle a également obtenu en moyenne un AUC de 0,64, une précision de validation de 0,70, une précision de 0,73 et un rappel de 0,56 sur les cinq plis de validation croisée. Cela suggère que le Deep Learning pourrait être utilisé pour prédire l'expression de PD-L1 sur un scanner pré-thérapeutique chez les patients atteints d'adénocarcinome gastrique avancé.

    Conclusion : Cette étude préliminaire suggère que le Deep Learning pourrait être utilisé pour estimer le CPS de manière simple, reproductible et non invasive dans le cancer de l'estomac avancé. Une cohorte de validation est nécessaire pour améliorer la précision du modèle et pour explorer les sources de biais et de variabilité.

  • Diagnostic de vaginose bactérienne : la PCR peut-elle remplacer le score de Nugent ?    - Gay Mathilde  -  09 octobre 2023  - Thèse d'exercice

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    La vaginose bactérienne, se définit comme une modification quantitative et qualitative du microbiote vaginal. Le score de Nugent qui consiste en une évaluation des morphotypes bactériens colorés au Gram est l'outil diagnostic de référence, mais cette technique doit reposer sur du personnel médico-technique expérimenté. La biologie moléculaire, encore peu évaluée à ce jour, propose une nouvelle approche pour ce diagnostic complexe. L'objectif de cette étude était double. D'une part, évaluer la fiabilité d'une lecture du score de Nugent réalisée par un technicien au laboratoire. D'autre part, comparer une technique de PCR multiplexe automatisée quantitative par rapport au score de Nugent.

    Au total, 78 prélèvements pour lesquels nous disposions d'une lame et d'un eSwab® ont été inclus. Les résultats de la lecture du score de Nugent réalisée en routine par le technicien ont été comparés aux résultats d'une lecture “consolidée” (double lecture technicien-biologiste, confirmée par un 3e opérateur sénior en cas de discordance). L'accord entre la lecture de routine et la lecture consolidée était « fort » avec un κ de Cohen à 0,768 (0,595−0,941) Cinq vaginoses (28%) n'étaient pas dépistées en lecture unique p = 0,3 (ns).

    Les résultats obtenus par la PCR Bacterial Vaginosis Plus Assay d'AllplexTM (Seegene®) réalisée sur la plateforme automatisée STARlet (Eurobio®) ont été comparés au score de Nugent consolidé. La concordance entre la PCR et le score consolidé était presque parfaite, κ = 0,862, (IC 0,775−1).

    Dans cette étude, Seegene AllplexTM BV Plus Assay a présenté des résultats comparables à la technique de référence. Son coût est élevé (>10€). Cependant, la PCR étant un outil facile d'utilisation, sa mise en place dans notre centre est envisagée. Toutefois, un échange préalable avec les gynécologues est souhaitable pour uniformiser les techniques à mettre en oeuvre devant chaque situation clinique.

  • Évaluation volumétrique de lésions gliales en imagerie par résonance magnétique 3 tesla : segmentation manuelle et segmentation automatique par algorithme d'intelligence artificielle    - Millet Léo  -  09 octobre 2023  - Thèse d'exercice

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    Introduction :

    L'IRM occupe une place centrale dans le diagnostic, et le suivi des lésions gliales, la volumétrie des lésions cérébrales est chronophage, fastidieuse pour le radiologue dans la pratique quotidienne. Dans cette étude le but a été de développer une intelligence artificielle de type TR-UNet capable d'effectuer des volumétries automatiques à la fois dans le bilan initial, dans le suivi des lésions gliales quel que soit le grade et le statut opéré ou non du malade.

    Matériels et méthodes :

    50 patients atteints de lésions gliales ont été segmenté manuellement par un radiologue pour servir de base d'entrainement à l'intelligence artificielle, et 7 patients atteints de glioblastome préalablement segmentés par un ingénieur ont servi de base de test. Le Dice score a été la métrique principale d'évaluation des volumétries automatiques.

    Résultats :

    La moyenne des Dice score sur la population test étaient de 0,83 en moyenne, donnant des segmentations automatiques satisfaisantes, les discordances était variables, dépendant principalement de l'aspect et de l'hétérogénéité des lésions.

    Il a été montré que le modèle d'intelligence artificielle TR-UNet était supérieure à un modèle d'intelligence artificielle UNet classique dans la segmentation des lésions gliales en condition réelle.

    Conclusion :

    L'intelligence artificielle de type TR-UNet est capable après un entrainement ciblé de segmenter automatiquement des lésions gliales avec une précision relativement bonne dépendant principalement de l'aspect et de l'homogénéité ou non des lésions cibles.

    En pratique courante une solution d'intelligence artificielle semble être une solution adaptée pour pallier à la segmentation manuelle, bien trop chronophage pour être viable en condition de pratique clinique réelle.

  • Corrélation entre l'indice de stase veineuse fémorale et la pression veineuse centrale au cours de la défaillance cardiaque droite en réanimation    - Lumineau Xavier  -  09 octobre 2023  - Thèse d'exercice

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    Introduction : L'élévation de la pression veineuse centrale (PVC) est associée à un mauvais pronostic chez les patients insuffisants cardiaques notamment en réanimation post chirurgie cardiaque. L'indice de stase veineuse fémorale (ISVF) mesuré en décubitus a récemment montré de bonnes performances diagnostiques pour détecter une élévation de la PVC, meilleure que l'analyse du diamètre de la veine cave inférieur (VCI), mais seulement dans une population ambulatoire atteinte majoritairement d'hypertension artérielle pulmonaire (HTAP).

    L'objectif principal de cette étude était d'évaluer la corrélation entre l'ISVF et la PVC chez des patients hospitalisés en réanimation post chirurgie cardiaque avec un suivi longitudinal et de valider ses performances diagnostiques pour détecter une PVC≥ 10mmHg.

    Matériel et méthodes : Une étude diagnostique, prospective, longitudinale, interventionnelle à risque minime, monocentrique, ouverte a été conduite de janvier 2023 à avril 2023. Les patients pour lesquels la PVC était mesurée en continu soit par sonde de Swan Ganz soit par cathéter veineux central dans le cadre des soins courants réanimatoires post chirurgie cardiaque ont été inclus. Une échographie Doppler veineuse était réalisée quotidiennement en position demi-assise pour la mesure de l'ISVF en respiration calme et moyen en en télé inspiration bloquée, mais aussi l'analyse du diamètre de la VCI. Un recueil de la mesure de la PVC était réalisé au même moment.

    Résultats : Neuf patients ont été inclus avec une durée de suivi moyenne de 2,3 jours permettant l'analyse de 22 mesures quotidiennes. 16 mesures quotidiennes (73%) mettaient en évidence une PVC ≥ 10mmHg. L‘ISVF en respiration calme ou moyen en télé inspiration bloquée étaient faiblement corrélé à la PVC (r <0,24). L'ISFV moyen en télé-inspiration bloquée présentait les meilleures performances diagnostiques échographiques qui restaient cependant mauvaises (sensibilité 33% et spécificité 83%) pour détecter une PVC≥10mmHg avec un seuil optimal plus élevé que dans l'étude précédente (0,34 contre 0,23). Les performances diagnostiques de l'analyse du diamètre de la VCI lorsqu'elle était réalisable (64%) étaient mauvaises (sensibilité 27% ; spécificité de 67%).

    Conclusion : Dans notre étude l'ISVF est faiblement corrélé à la PVC et présente de mauvaises performances diagnostiques pour détecter une élévation de la PVC chez les patients en réanimation post chirurgie cardiaque. Ces résultats sont probablement explicables par la position demi-assise des patients qui ont pu augmenter l'ISVF et fausser les mesures de la PVC. L'ISVF doit être analysé chez des patients en décubitus.

  • Les violences verbales chez les femmes victimes de violences conjugales : les insultes, leurs déterminants et leurs conséquences    - Mettilion Aziyadé  -  09 octobre 2023  - Thèse d'exercice

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    Introduction – Au cours des violences conjugales, les violences verbales sont souvent les premières à s’installer dans la dynamique de couple et représentent les violences les plus fréquentes. Elles sont insidieuses, parfois minimisées voire banalisées par les victimes. Pourtant, elles sont à l’origine de conséquences majeures à court et long terme.

    Objectifs – Analyser les liens entre les violences verbales, notamment la présence d’insultes, les autres types de violences, les processus de déshumanisation, l’existence d’un retentissement sur les victimes et la gravité des faits. Évaluer les pratiques professionnelles concernant le recueil des violences verbales lors de la consultation de victimologie dans les différentes UMJ de France et leur mention dans le rapport médico-légal.

    Méthodologie – Nous avons réalisé trois études complémentaires. Les études 1 et 3 sont des études épidémiologiques, monocentriques, rétrospectives, observationnelles et analytiques. La première correspond à l’analyse de 1 345 dossiers de femmes victimes de violences conjugales, reçues en consultation à l’UMJ du CHU de Poitiers, entre le 1er janvier 2015 et le 31 décembre 2021. La troisième correspond aux résultats préliminaires de la même étude, réalisée du 8 juin au 8 septembre 2023, après modification de la trame d’entretien. L’étude 2 est une étude épidémiologique transversale, observationnelle et descriptive, s’intéressant aux pratiques professionnelles dans les différentes UMJ de France, concernant le recueil des violences verbales, et notamment des insultes, lors de la consultation de victimologie. Il s’agit d’une enquête réalisée au moyen d’un questionnaire en ligne.

    Résultats – Ce travail nous a permis d’observer une association significative entre la présence de violences verbales, d’insultes et l’existence d’une atteinte psychologique. L’existence de violences verbales et d’insultes sont associées à la présence de l’ensemble des autres formes de violences investiguées. On observe une tendance non linéaire entre la présence d’insultes déshumanisantes et la gravité des faits. Les agresseurs graves utilisent plus d’insultes déshumanisantes envers leurs victimes que les agresseurs simples et que les agresseurs extrêmes.

    En France, dans les UMJ, l’existence de violences verbales est recherchée de façon systématique. Une multitude de paramètres composant ce type de violences est sondée en consultation. Parmi eux, les plus recherchés par les praticiens sont respectivement les insultes, les propos rabaissants et les menaces. Concernant les insultes, trois pratiques se distinguent parmi les médecins légistes : d’une part ceux qui se limitent à une investigation binaire de la présence ou de l’absence d’insultes et d’autre part ceux qui examinent le détail des insultes, qu’ils les mentionnent dans le rapport médico-légal ou non.

    Discussion – Les violences verbales et plus largement les violences psychologiques sont, par nature, moins évidentes et plus difficile à reconnaître, ce qui enferme petit à petit les femmes dans un environnement violent. Le développement d’outils de repérage à destination des femmes mais aussi des professionnels de santé de première ligne est un axe de prévention majeur. La détection précoce de ces formes de violence est une nécessité pour permettre aux femmes de s’extraire le plus rapidement possible d’une situation de violences conjugales. La discordance entre l’existence d’une atteinte et la durée de l’ITT établie pose la question de la pertinence de ce critère dans l’évaluation du retentissement, notamment psychologique. Ce contraste est particulièrement visible dans le cas des violences verbales, fortement pourvoyeuses de ces atteintes psychiques.

    Conclusion – Ce travail met en avant les facteurs environnants et les conséquences des violences verbales dans le couple. Elles exposent les femmes qui en sont victimes à d’autres types de violences et au développement de symptômes psychologiques. La poursuite d’études de ce type est primordiale pour approfondir les connaissances sur ce sujet encore trop peu développé. L’engagement d’une réflexion commune, en collaboration avec les acteurs de la santé, de la justice et du médico-légal, est un facteur de l’amélioration de la prise en charge globale des victimes.

  • Performance du scanner thoracique pour le diagnostic de la COVID-19 dans une région de faible incidence et faible prévalence (Poitou-Charentes, 2020)    - Thomas Clement  -  06 octobre 2023  - Thèse d'exercice

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    Contexte et objectif : L'intérêt du scanner thoracique a été principalement étudié dans des zones de forte incidence de COVID-19. Le but de cette étude était d'évaluer les performances du scanner thoracique pour le diagnostic de pneumopathie à COVID-19 dans une zone de faible prévalence et incidence et avec pour gold standard la RT-PCR (test nasopharyngés).

    Matériel et méthodes : L'étude a été réalisé dans 4 services de radiologie de la région Poitou-Charentes, zone de faible prévalence de COVID-19 (3,4 %), du 18 mars au 24 avril 2020 (pendant la première vague épidémique). Le design de l'étude a été approuvé par le comité d'évaluation de l'éthique local et enregistré sur le site internet clinicaltrial.gov (NCT04339686). Les patients ayant bénéficié d'une RT-PCR et d'un scanner thoracique pour suspicion de COVID-19 ont été consécutivement inclus. Les performances diagnostiques incluant le sensibilité, spécificité, valeur prédictive positive et valeur prédictive négative ont été calculées.

    Résultats : Cent vingt-neuf patients ont eu des résultats de scanner thoracique évocateurs de pneumopathie à COVID-19 (26%, 129/487). Parmi les trois cent cinquante-huit scanners thoraciques non évocateurs, 3% (10/358) avaient une RT-PCR positive. Les sensibilité, spécificité, valeur prédictive positive et négative du scanner étaient respectivement de 87% (IC95 : 85,89; 69/79), 85% (IC95 : 83,87; 348/408), 53% (IC95 : 50,56; 69/129) et 97% (IC95 : 95,99; 348/358).

    Conclusion : Dans une zone de faible prévalence et faible incidence (Poitou-Charentes), le scanner thoracique fut un outil diagnostic utile pour éliminer une pneumopathie à COVID-19 parmi des patients symptomatiques avec suspicion d'infection.

  • Endométriose : l’espoir de l’Endotest    - Sohm Oceane  -  06 octobre 2023  - Thèse d'exercice

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    L’endométriose est une maladie multifactorielle, complexe, polymorphe, qui peut s’avérer très invalidante. Son diagnostic tardif est un obstacle à la mise en place d’une prise en charge adaptée. En France, l’errance diagnostique est estimée à 7 ans malgré les efforts déployés et les techniques d’imagerie disponibles. L’émergence d’un nouveau test de diagnostic rapide, fiable et non invasif est très attendue par la communauté scientifique et médicale. Le cas échéant, cela susciterait un réel intérêt auprès des femmes, comme en témoigne l’enquête que nous avons menée. En réponse à ce besoin, l’entreprise Ziwig vante aujourd’hui les mérites de l’Endotest®. Cette innovation, utilisant le Séquençage de Nouvelle Génération (NGS) et l’Intelligence Artificielle (IA), pourrait diagnostiquer l’endométriose en quelques jours à partir d’un simple échantillon de salive. Les résultats des premières études sont encourageants et prometteurs. Par cette thèse, nous abordons à la fois les potentiels et les limites de ce nouveau test.

  • Dépression résistante et eskétamine : une issue à l’impasse thérapeutique ?    - Lerno Emma  -  05 octobre 2023  - Thèse d'exercice

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    La molécule d’eskétamine, bien que découverte depuis de nombreuses années, n’est que récemment utilisée dans le traitement de la dépression. En effet, elle occupe depuis peu une place centrale dans la prise en charge des patients développant une forme dite résistante à l’ensemble de l’arsenal thérapeutique disponible sur le marché. Dans cette situation d’impasse thérapeutique le risque suicidaire du patient atteint son paroxysme, les laboratoires Janssen ont commercialisé un spray nasal nommé Spravato.

  • Création d'un groupe Facebook® à l'usage des médecins de la région Poitou-Charentes : Évaluation de l'aide ressentie par les utilisateurs dans leur pratique professionnelle    - Rigaut Florian  -  05 octobre 2023  - Thèse d'exercice

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    Introduction : Facebook est le réseau social le plus utilisé dans le monde avec 2,9 milliards d'utilisateurs. Il est un nouveau lieu d'échanges de pratiques entre médecins à travers divers groupes dont « Le divan des médecins » fort de 27000 membres. Les publications issues de ces groupes s'apparentent à de la formation médicale continue formelle ou informelle. Elles constituent un soutien psychologique pour les membres via le partage d'expériences.

    Méthode : Nous avons réalisé une étude pilote interventionnelle descriptive de type avant/après sur trois mois. Notre critère de jugement principal était un critère composite de 7 questions dont les réponses étaient notées de 1 à 5 sur une échelle de Likert. Notre objectif principal était d'évaluer le ressenti de l'aide apportée par les réseaux sociaux aux médecins adhérents au groupe Facebook que nous avons créé pour cette étude : « le divan du Poitou-Charentes ». Les critères de jugements secondaires évaluaient l'aide ressentie sur la résolution de problèmes médicaux, sur le moral, sur l'accès aux initiatives locales, sur l'adressage aux confrères, sur la gestion des situation sanitaires exceptionnelles, sur la relation médecin/malade, sur la résolution de problèmes administratifs.

    Résultats : L'effectif était de 69 médecins ayant répondu aux questionnaires avant et après.Nos résultats étaient significatifs sur notre critère de jugement principal (24,6 avant et 25,3 après avec p<0,01) en faveur d'une amélioration de l'aide ressentie par les médecins de l'usage des réseaux sociaux à visée professionnelle. L'analyse individuelle des sept critères choisis montre une amélioration minime de chacun au cours de l'étude.

    Conclusion : Les réseaux sociaux « privés » de santé à l'instar de notre groupe Facebook semblent constituer une aide dans le quotidien du médecin en 2023.Définir le champ d'action de chaque réseau social permettrait d'en définir les modalités d'usage à visée professionnelle les plus optimales.

  • Etude observationnelle sur l’impact de la sialorrhée dans le sevrage ventilatoire en Neuroréanimation - SIALO-Rea    - Bernard Oceane  -  05 octobre 2023  - Thèse d'exercice

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    Introduction : L’extubation orotrachéale du patient cérébrolésé est un défi quotidien en Neuroréanimation et une durée de sevrage ventilatoire augmentée est associée à une morbi-mortalité accrue. La gestion du carrefour aéro-digestif se révèle importante dans le succès de l’extubation et d’autant plus chez le patient cérébrolésé où l’agression cérébrale aigue peut être responsable de troubles de déglutition et d’hypersialorrhée. L’objectif de cette étude est d’évaluer l’impact de la sialorrhée sur la durée de sevrage ventilatoire du patient cérébrolésé en Neuroréanimation.

    Matériel et Méthode : Une étude pilote, observationnelle, rétrospective et monocentrique a été menée en service de Neuroréanimation au CHU de Poitiers. Elle incluait les patients cérébrolésés majeurs, sous ventilation mécanique, ayant bénéficié d’une évaluation de la sialorrhée à l’aide de l’échelle de sialorrhée DSFS, à partir de la première épreuve de sevrage ventilatoire réussie. Un score > 5 sur l’échelle DSFS définissait l’hypersialorrhée. Le critère de jugement principal était la durée de sevrage ventilatoire. L’échec d’extubation, les complications respiratoires et la durée d’hospitalisation représentaient les critères de jugement secondaires.

    Résultats : 56 patients ont été analysés entre juin 2022 et juillet 2023, répartis en deux groupes : 23 patients « Sialorrhée acceptable » et 33 patients « Hypersialorrhée ». Il existait une augmentation significative de 4,9 jours de la durée de sevrage ventilatoire en analyse multivariée dans le groupe « Hypersialorrhée ». La durée d’hospitalisation, ainsi que la durée totale de ventilation mécanique étaient plus importantes dans le groupe « Hypersialorrhée ». Il n’y a pas de différence sur le taux d’échec d’extubation ni sur les complications respiratoires entre les deux groupes.

    Discussion : Nos résultats ont montré que l’hypersialorrhée était associée à une augmentation de la durée de sevrage ventilatoire en Neuroréanimation de manière significative et de la morbi-mortalité. Il n’y avait pas d’augmentation du taux d’échec d’extubation. L’évaluation de la sialorrhée par l’échelle DSFS et la mise en place de traitements anti-sialorrhéiques semblent être une piste d’étude pour la gestion de l’extubation du patient cérébrolésé.

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