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Évaluation d'un panel de biologie moléculaire d'approche syndromique pour la recherche de virus entériques dans les selles chez des patients immunodéprimés et immunocompétents : comparaison de 2 méthodes de diagnostic microbiologique.

L'avènement des techniques de biologie moléculaire a permis de mettre en exergue la responsabilité des virus entériques dans la survenue de diarrhées infectieuses chez le patient immunodéprimé. L'objectif de ce travail était d'évaluer la pertinence de l'utilisation d'une méthode PCR d'approche syndromique dans le cadre du diagnostic microbiologique d'une diarrhée infectieuse, en la comparant à un test d'immunochromatographie utilisé pour la détection de virus entériques à partir d'échantillons de selles recueillies de façon prospective & issues de patients immunodéprimés et non immunodéprimés.

183 échantillons de selles liquides ont été testés, issus de 155 patients dont 87 étaient considérés comme immunodéprimés. La comparaison des méthodes diagnostiques a permis de montrer une très bonne concordance entre le panel de PCR multiplex Allplex GI Virus Assay de Seegene et le test comparateur immunochromatographique Rida Quick pour la recherche des adénovirus 40/41 (κ = 0.861) et des rotavirus du groupe A (κ = 0.957) dans les selles, ainsi qu'une bonne concordance pour la détection des norovirus GI/GII (κ = 0.614). Les performances diagnostiques du test Allplex GI Virus Assay offrent la possibilité de mettre en évidence des infections qui étaient autrefois ignorées ou non recherchées telles que les infections à sapovirus ainsi que des co-infections pour laquelle le Cycle Threshold constitue une aide à l'interprétation des résultats.

Mots-clés libres : PCR, NOROVIRUS, IMMUNODEPRESSION, COMPARAISON DE METHODES, CYCLE THRESHOLD.

Rameau (langage normalisé) :
• Diarrhée -- Étiologie
  
• Immunosuppression
  
• Virus entériques -- Diagnostic biologique
  
• PCR (génétique)