Thèse d'exercice
Retards staturaux liés au gène SHOX : étude rétrospective multicentrique sur l'implication des CNVs et l'apport du séquençage
Français
Travail non accessible
Le retard de croissance statural, pouvant être défini par une taille inférieure à -2 DS, concerne environ 3% de la population. La mise en évidence d'un variant pathogène dans le gène SHOX dans ce contexte permet de proposer l'instauration d'un traitement par hormone de croissance afin de favoriser le pronostic statural.
Le laboratoire de génétique constitutionnelle du CHU de Poitiers propose depuis 2018 l'analyse du gène SHOX en recherchant les anomalies du nombre de copies (CNVs) par MLPA et les variants nucléotidiques par séquençage Sanger. Le taux de détection par séquençage étant très faible, nous nous sommes interrogés sur la pertinence du séquençage chez l'ensemble des patients présentant un retard de croissance ou s'il pouvait être réalisé seulement chez les patients suspects de dyschondrostéose de Léri-Weill.
Après appel à collaboration national, nous avons réalisé cette étude rétrospective, multicentrique, composée de deux cohortes : la cohorte A ayant pour objectif d'actualiser les connaissances concernant les CNVs dans une population française ; et la cohorte B ayant pour objectif d'évaluer l'intérêt du séquençage en l'absence de CNV selon le contexte clinique.
Notre étude a permis d'enrichir les connaissances concernant une délétion récurrente de 47,5 kb des régions régulatrices en 3' impliquant les éléments régulateurs CNEs 7 et 8. Elle semble avoir un mécanisme différent de l'haplo-insuffisance habituellement décrite pour ce gène. Nous avons collecté des données concernant les duplications dont la pénétrance est incomplète et l'expressivité variable également, dépendant des éléments régulateurs impliqués dans le remaniement génomique.
Concernant le séquençage de SHOX après analyse des CNVs, cette étude a montré qu'il est nécessaire de l'effectuer chez l'ensemble des patients, même si le taux de détection reste faible chez ceux atteints de petite taille idiopathique. L'utilisation d'un score de Rappold révisé, utilisant des critères plus stringeants évoquant le diagnostic de dyschondrostéose de Léri-Weill, ne permet pas d'améliorer le rendement diagnostique du séquençage.
Mots-clés libres : SHOX - retard de croissance - dyschondrostéose de Léri-Weill - petite taille idiopathique.
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