UPmémoires

• Français

Français

Faisabilité et intérêt de l'analyse de l'exome dans la période prénatale

Introduction : Avec le formidable développement des technologies génétiques, de nouveaux outils sont à la disposition des généticiens pour la démarche diagnostique des maladies rares. L'un de ces outils est le séquençage haut-débit de l'exome. A travers deux études, nous avons étudié la faisabilité et l'intérêt de ce test génétique devant des anomalies échographiques fœtales découvertes au cours de la grossesse.

Méthodes : Après avoir défini un protocole technique et un champ d'indications, nous avons sélectionné 4 fœtus qui ont bénéficié de l'analyse de l'exome en simplex afin d'évaluer la qualité du séquençage sur différents prélèvements. Puis sur une cohorte de 12 fœtus analysés, nous avons évalué l'intérêt de cette analyse à travers sa rentabilité diagnostique, le délai de mise à disposition des variants au biologiste et le bénéfice apporté aux couples.

Résultats : Les critères de qualité du séquençage de l'exome sont satisfaisants quel que soit le type de prélèvement ovulaire. L'analyse de l'exome permet de poser un diagnostic chez 33% des fœtus de la cohorte. La rentabilité atteint 50% avec l'étude de ségrégation. Le délai nécessaire à la réalisation de l'analyse est de 5 semaines en moyenne. Le bénéfice de ce test pour le couple dans le cadre de sa prise en charge par le CPDP semble exister.

Conclusion : L'analyse de l'exome apparaît comme une approche complémentaire au bilan génétique déjà réalisé en routine en médecine fœtale. La possibilité d'un diagnostic génétique prénatal de maladie monogénique dans le délai imparti de la grossesse se dessine pour les couples à la recherche d'un pronostic et d'une prise en charge périnatale optimisée. Avant d'imaginer l'analyse de l'exome prénatal en routine, il faudra attendre la mise en place d'autres descriptions de cohortes de fœtus bénéficiaires de cette analyse.

Mots-clés libres : génétique, obstétrique, médecine fœtale, bio-informatique, laboratoire, échographie, grossesse, fœtus, anomalie congénitale, centre pluridisciplinaire de diagnostic prénatal, analyse de l'exome, séquençage haut-débit, mutation, faisabilité, intérêt, rentabilité diagnostique.

Rameau (langage normalisé) :
• Diagnostic prénatal
  
• Foetus -- Maladies
  
• Séquençage à haut débit