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Thèse d'exercice

Mériglier Étienne-Marie

Étude de la cinétique d'adaptation d'une souche de Pseudomonas aeruginosa à la ciprofloxacine et au méropénème par mesures de bioluminescence in vitro

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Résumé

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Étude de la cinétique d'adaptation d'une souche de Pseudomonas aeruginosa à la ciprofloxacine et au méropénème par mesures de bioluminescence in vitro

Objectif : Analyser la cinétique d'apparition de résistance au cours du temps d'une souche de Pseudomonas aeruginosa in vitro en présence de différentes concentrations de ciprofloxacine ou de méropénème par mesure de bioluminescence et évaluer la restauration de la sensibilité de la bactérie en l'absence d'antibiotique. L'objectif secondaire est de déterminer les mécanismes de résistances impliquées dans la résistance de la bactérie.

Méthodes : Réalisation de deux courbes de bactéricidie consécutives in vitro à partir d'une souche de Pseudomonas aeruginosa PAO1 rendue bioluminescente par insertion de l'opéron luxCDABE en présence de différentes concentrations de ciprofloxacine et de méropénème. La quantification bactérienne se fait par mesures de bioluminescence à partir de IVIS® Lumina XR (Caliper Life Sciences, Hopkinton, MA) aux temps 0, H2, H4, H6, H8, H12, H24, H28 et H32. Les 2èmes courbes de bactéricidie sont réalisées suivant ou non une période de culture bactérienne en l'absence de ciprofloxacine ou de méropénème (périodes de wash-out de 18h, 42 et 66h).

Résultats : En présence de ciprofloxacine et de méropénème, le Pseudomonas aeruginosa acquiert des résistances entre la 12ème et 24ème heure se traduisant par une repousse des bactéries. La seconde exposition à l'antibiotique permet l'acquisition d'une résistance de plus haut niveau. Les mécanismes de résistance font intervenir la surproduction de la pompe d'efflux MexCD-OprJ pour la ciprofloxacine et par la répression du gène OprD pour le méropénème. Une période de wash-out allant jusqu'à 66h ne permet pas de restaurer la sensibilité de la bactérie.

Conclusion : Le Pseudomonas aeruginosa est capable d'acquérir rapidement des résistances stables à la ciprofloxacine et au méropénème. Les mécanismes de résistance font intervenir des mutations sur les pompes d'efflux pour la ciprofloxacine et sur la porine OprD pour le méropénème. Les résistances se font par palier jusqu'à des hauts niveaux de résistance. La bioluminescence apparait comme un nouvel outil dans la recherche en temps réel la vitesse d'apparition et le niveau de résistances aux antibiotiques.

Mots-clés libres : Pseudomonas aeruginosa, bioluminescence, pharmacocinétique/pharmacodynamie, ciprofloxacine, méropénème.

    Rameau (langage normalisé) :
  • Pseudomonas aeruginosa
  • Ciprofloxacine
  • Méropénème
  • Bioluminescence
  • Pharmacocinétique
  • Pharmacodynamie

English

Objective: Describe the effect of ciprofloxacine and meropenem against Pseudomonas aeruginosa in vitro by bioluminescence and evaluate the restoration of the sensibility of the bacteria without antibiotic. Determinate the mechanisms of resistance. Methods: Realisation of two consecutive kill curves with a strain of Pseudomonas aeruginosa PAO1 made bioluminescent by insertion of operon luxCDABE with different concentrations of ciprofloxacine and meropenem. At 0, 2, 4, 6, 8, 12, 24, 28 and 32h, bioluminescence was measured by a photon counter IVIS® Lumina XR (Caliper Life Sciences, Hopkinton, MA). The second time kill curves were done after a period of growth in an antibiotic-free broth without antibiotic (wash-out 18h, 42h and 66h). Results: With ciprofloxacine and meropenem, an initial bioluminescent decay followed by regrowth was observed between 12 and 24h attesting the rapid emergence of resistance. The second kill curves elicited the apparition of high level of resistance. This phenomenon was mainly due to an overexpression of the MexCD-OprJ efflux pumps for ciprofloxacine whereas an overproduction of active efflux pump along with a modification of OprD dominated in meropenem resistance. There was no restoration of sensibility of the bacteria after 66h of growth without antibiotic. Conclision: Pseudomonas aeruginosa can develop rapidly a stable resistance to ciprofloxacine and meropenem. This phenomenon was mainly due to an overexpression of the MexCD-OprJ efflux pumps for ciprofloxacine and overproduction of active efflux pump and a modification of the OprD porine for meropenem resistance. These mechanisms resulted in high level of resistances. Bioluminescence is a new method to evaluate the rate and the extent of resistance development, such as to evaluate the restoration of sensibility over the time.

Keywords : Pseudomonas aeruginosa, bioluminescence, pharmacokinetic / pharmacodynamic, ciprofloxacine, meropenem.

Notice

Diplôme :
Diplôme d'état de médecine
Établissement de soutenance :
Université de Poitiers
UFR, institut ou école :
Domaine de recherche :
Médecine. Médecine interne
Directeur(s) du travail :
Nicolas Gregoire
Date de soutenance :
26 septembre 2016
Président du jury :
France Cazenave-Roblot
Membres du jury :
Nicolas Gregoire, Marc Paccalin, Pascal Roblot, Blandine Rammaert-Paltrie

 

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